move tool 인 상태에서 커맨드를 누르고 레이어를 클릭하신게 아닌지요..
선택한 레이어의 투명부분을 위와같이 클릭하면
선택하고자 하는 레이어가아닌, 클릭한 부분이 채워져있는 레이어가 선택이 되거든요~